В 1978 году окончил Казанскую государственную консерваторию им.Н.Жиганова (класс В.А.Воронова и М.Ф.Кольцова). Еще будучи студентом, в 1976 году поступил в ТАГТОиБ им.М.Джалиля в стажерскую группу. В 1978 году был принят на основную работу солистом оперы Татарского академического государственного театра оперы и балета им.М.Джалиля. В первые годы работы в театре исполнил ряд партий: Марулло («Риголетто» Дж.Верди), Барон («Травиата» Дж.Верди), Фальк («Летучая мышь» И.Штрауса), Шонар («Богема» Дж.Пуччини ), Сыщик («Башмачки» Дж.Файзи), Бай («Черноликие» Б.Мулюкова). В 1981 г. за успешное исполнение партии Князя Игоря («Князь Игорь» А.Бородина) на конкурсе молодых певцов в Казани был награжден путевкой в международный молодежный лагерь. Был первым исполнителем партии Тукая в опере А.Бакирова «Тукай» (концертное исполнение, дирижер – Н.Г.Рахлин), партии Сафагирея в опере Б.Мулюкова «Сююмбике» (концертное исполнение, дирижер – И.Лацанич). Исполнил на сцене ТАГТОиБ им.М.Джалиля партию Томского в опере «Пиковая дама» вместе с народным артистом СССР Владимиром Пьявко (Герман) и народной артисткой СССР Еленой Образцовой (Графиня). За участие в Днях культуры Республики Татарстан в Кара-Калпакской АССР (Узбекистан) был награжден Почетной грамотой Обкома партии и Совета Министров Республики Татарстан. В 1987 году был удостоен звания «Заслуженный артист Республики Татарстан», в 1997 году – «Народный артист Республики Татарстан».
В репертуаре Якупова – ведущие баритоновые партии мировой оперной классики: Грязной («Царская невеста» Н. А. Римского-Корсакова), Эскамильо («Кармен» Ж. Бизе), Скарпиа («Тоска» Дж. Пуччини), Рангони («Борис Годунов» М.Мусоргского), партии в опереттах «Летучая мышь», «Баядера», «Здравствуйте, я ваша тетя»; партии в операх татарских композиторов: Хан («Алтынчеч» Н. Г. Жиганова), Ишназаров («Джалиль» Н.Жиганова) и др. С труппой театра неоднократно выезжал на гастроли по городам России (Омск, Томск, Астрахань, Сочи, Ростов, Смоленск, Тамбов, Пенза, Оренбург и др.) и страны Европы. В 2006 г. Мунир Ахатович блестяще исполнил партию Фатыха в премьере оперы Р.Ахияровой «Любовь поэта», за которую был номинирован на получение Государственной премии Татарстана им.Г.Тукая и Национальной театральной премии «Золотая маска». Дает сольные концерты с оркестром народных инструментов «Tatarica».
